中心是由煙臺市政府舉辦的實施疾病預防控制與公共衛生服務的正處級公益一類事業單位。中心現有辦公區2個，總部位于萊山區府后路17號，西區位于萊山區新苑路5號。總占地面積20畝，建筑面積1.49萬平方米，其中實驗室用房3600平方米。人員編制288人，內設科室36個。中心主要承擔全市疾病預防控制、突發公共衛生事件應急處置、疫情及健康相關因素信息管理、健康危害因素監測與控制、實驗室檢測分析與評價、健康教育與健康促進、技術指導培訓及科學技術應用研究等工作，受煙臺市衛生健康委員會委托承擔全市行政區域內衛生健康監督執法工作。中心掛煙臺市衛生監督所、煙臺市預防醫學研究所、煙臺市食品安全風險評估中心、煙臺市衛生檢驗檢測中心牌子，是山東大學、山東第一醫科大學、山東第二醫科大學、煙臺大學、濟寧醫學院、濱州醫學院、山東中醫藥高等專科學校、煙臺理工學院的實踐教學基地。