新疆醫學會是新疆各族醫學科學技術工作者自愿組成并依法登記成立的學術性、公益性、非營利性法人社團，是自治區黨委和政府聯系醫學科技工作者的橋梁和紐帶，是發展自治區醫學科學技術事業的重要社會力量。新疆醫學會成立于1951年，目前有65個專業委員會，104個專業學組，50個青年委員會。業務主管單位為自治區衛生健康委員會，現掛靠在自治區醫療衛生服務管理指導中心。新疆醫學會主要工作包括開展國際間、區內外醫學學術交流；繼續醫學教育；醫學科技項目的評價、評審和醫學科學技術決策論證；評選和獎勵優秀醫學科技成果（包括學術論文和科普作品等）；編輯出版《新疆醫學》雜志；醫療事故技術鑒定和預防接種異常反應技術鑒定；健康知識科學普及；承接政府委托職能及任務；向黨和政府反映醫學科技工作者的意見和要求。經過歷屆理事會的不懈努力，新疆醫學會已發展成為擁有個人會員2萬人、團體會員單位149家的醫學科技工作者之家，為中華醫學會優秀地方醫學會，自治區民政廳5A級社團組織，連續多年獲得自治區科協先進學會稱號。