1860年及1900年，圓明園兩度罹劫時，因正覺寺獨處綺春園墻外而幸免于難。但據說該寺曾一度為義和團占用。八國聯軍侵華時，駐在對面朗潤園的德軍收容所，毀壞了本寺一些門窗和佛像。民國初年，正覺寺被曾任北洋政府代國務總理的顏惠慶購作私人別墅，拆去佛像，改造裝修，資遣喇嘛。后又轉售清華大學為教職員工宿正覺寺的修繕舍。從70年代起，正覺寺為海淀機械制造廠（今北京長城鍋爐廠）等占用。現僅殘存山門、文殊亭和四座配殿及26株古樹。圓明園管理處從2002年開始對正覺寺進行清理，并委托北京市文物建筑保護設計所對正覺寺的修繕復建進行了設計，正覺寺一期修繕工程于當年年底開始進行，2003年9月底竣工。正覺寺，位于綺春園正宮門之西，與綺春園既有后門相通，而又獨成格局，單設南門。正覺寺實際上是清帝御園圓明園附屬的一座佛寺，俗稱喇嘛廟。占地12660平方米，建筑面積近3000平方米。該寺于乾隆三十八年（1773年）建成，由二名喇嘛住持。寺內設僧房八座22間，由正覺寺山門、天王殿、三圣殿、文殊亭、*上樓、配殿等主要建筑組成。正覺寺山門外檐刻有“正覺寺”三字，為乾隆御書，漢、滿、藏、蒙四種文字合璧。文殊亭為八方重檐亭，外檐匾上有“文殊亭”三個字。該亭又稱殊像閣、文殊閣。據記載，文殊閣內奉有文殊菩薩騎青獅之像，總高二丈有余。文殊菩薩像及其背光均為木制包金，下乘白玉石臺。*上樓有后樓七間，樓東西各三間順山殿